Malezja jest krajem stosunkowo bezpiecznym, w którym dba się o zadowolenie turystów. Nie ma tam stałych zagrożeń sanitarno-epidemiologicznych, a kiedy pojawia się coś niebezpiecznego, zazwyczaj donoszą o tym wszystkie lokalne media, również w języku angielskim. Wystarczy więc monitorować ten temat, by być stosunkowo bezpiecznym. Nie ma obowiązkowych szczepień, ale zalecane są szczepienia na: wirusowe zapalenie wątroby A, B i C, błonicę, tężec, polio i dur brzuszny.
Ubezpieczenie zdrowotne oczywiście jest zalecane. Państwowe i prywatne szpitale znajdują się we wszystkich głównych miastach i radzą sobie z zaspokojeniem głównych potrzeb medycznych, ale we wszystkich obowiązują opłaty za leczenie. Standardy są na ogół wyższe w prywatnych szpitalach. Większość prywatnych szpitali w obszarach miejskich, w odróżnieniu od wielu placówek publicznych, jest wyposażona w najnowsze urządzenia diagnostyczne. Ceny za usługi medyczne również mogą być bardzo różne. Za wizytę u lekarza ogólnego nie powinniśmy zapłacić więcej niż równowartość 10 dolarów, ale wizyta u lekarza-specjalisty, to już wydatek rzędu 100 dolarów. W nagłych wypadkach trzeba dzwonić pod numer 999.
Lokalne jedzenie jest jedną z głównych atrakcji podczas pobytów turystycznych w Malezji, trzeba jednak na nie uważać, gdyż standardy higieny mogą być, delikatnie mówiąc, różne. Restauracje są zazwyczaj w porządku, równie bezpieczne powinny być uliczne stragany, na których żywność jest przygotowywana na miejscu. Trzeba unikać miejsc, gdzie żywność mogła dłużej leżeć na powietrzu. Trzeba też unikać lodów i innych niepasteryzowanych produktów mlecznych, ponieważ mogą one być rozmrażane i ponownie zamrażane.
Woda z kranu w dużych miastach jest zazwyczaj bezpieczna, ale większość ludzi woli pić wodę mineralną. Poza miastami wszystkie wody powinny być traktowane jako potencjalnie skażone.
Malaria i wirusowe zapalenia wątroby typu A i C są w Malezji dość powszechne, a zapalenie wątroby typu B nawet bardzo częste. Jednak ryzyko dla turystów jest bardzo małe. Ogniska gorączki denga, zapalenie opon mózgowych i japońskie meningokoki występują co prawda w obszarach miejskich i wiejskich, ale są bardzo rzadkie w Kuala Lumpur, Penang i w kurortach nadmorskich. Obecna jest również wścieklizna, dlatego ugryzienia przez małpy i psy muszą być natychmiast konsultowane z lekarzem.
